实验室洁净系统是在一定空间范围内，将空气中的微粒子、有害空气、细菌等污染物排除，并将室内温度、洁净度、压力、气流速度与气流分布、噪音振动及照明、静电控制在某一需求范围内的工程学科。净化工程所特别设计的房间，不论外在空气条件如何变化，室内均具有维持原先所设定要求之洁净度、温湿度及压力等性能。

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洁净室主要控制有生命微粒(细菌)与无生命微粒(尘埃)对工作对象的污染。生物控制洁净室又可分为:

一般生物洁净室:主要控制微生物(细菌)对象的污染。同时其内部材料要能经受各种剂侵蚀，内部一般保证正压。实质上其内部材料要能经受各种处理的工业洁净室。例:制药工业、医院(手术室、无菌病房)食品、化妆品、饮料产品生产、动物实验室、理化检验室、血站等。

生物学安全洁净室:主要控制工作对象的有生命微粒对外界和人的污染。内部要保持与大气的负压。例:细菌学、生物学、洁净实验室、物物工程(重组基因、疫苗制备)。

洁净室按照室内空气洁净度又分为百级、千级、万级、十万级等。